新手性柱不能直接用水乙腈等反相模式進行儀器分析的原因主要有以下幾點：

### 一、手性柱的結構強度

手性柱的結構強度通常比常用的C18等色譜柱要差，因此在使用過程中需要更加小心謹慎。直接使用水乙腈等反相模式，可能會對手性柱的內部結構造成不必要的沖擊和損害，從而影響其使用壽命和分離效果。

### 二、溶劑特性

1. **乙腈**：乙腈具有氧化性，這種特性可能會對手性柱的固定相造成損害，進而影響其分離性能。
2. **水**：雖然水是常用的溶劑之一，但在某些情況下，水可能會與手性柱中的某些成分發生反應，導致柱效下降或分離效果不佳。

### 三、流動相的選擇與優化

1. **流動相組成**：手性分離通常需要使用特定的流動相組成，以達到最佳的分離效果。直接使用水乙腈等反相模式，可能無法獲得理想的分離效果。
2. **流動相比例**：在反相模式中，有機相（如乙腈）和水相的比例對分離效果有重要影響。不同的比例可能會導致分離度的顯著變化，因此需要進行仔細的優化和調整。

### 四、操作建議

1. **樣品溶解**：雖然樣品可以用純的有機溶劑溶解，但最好用流動相來稀釋，以延長色譜柱的使用壽命。
2. **沖洗與封存**：在使用含酸/堿添加劑的反相流動相后，需要用特定的比例（如乙腈/水=90/10）沖洗色譜柱一段時間，并用相同的比例封存，以保護手性柱的內部結構。

綜上所述，新手性柱在使用時需要特別注意溶劑的選擇和流動相的優化，以確保其最佳的分離效果和較長的使用壽命。因此，不建議直接用水乙腈等反相模式進行儀器分析。